Die von den zuständigen Stellen für die Bekämpfung der Aviären Influenza festgelegte Gesundheitsprüfung ist nicht nur mit den wirtschaftlichen Auswirkungen des Todes von Tieren verbunden, sondern wirft auch besondere Bedenken hinsichtlich der öffentlichen Gesundheit auf . Experten befürchten vor allem, dass neue virale Subtypen beim Menschen Krankheiten auslösen und vor allem von Mensch zu Mensch übertragen können. Influenzaviren vom Typ A unterliegen in der Tat Phänomenen der genetischen Neuordnung mit hoher Häufigkeit; Dies ermöglicht eine bemerkenswerte Anpassungsfähigkeit an neue Gäste und bestimmt das kontinuierliche Auftreten neuer Virusstämme . Diese Mutationen können beispielsweise auftreten, wenn ein menschliches Virus und ein Vogelvirus ihr genetisches Erbe "austauschen" oder wenn das Virus von einer Tierart auf eine andere übergeht (der Übergang von Vögeln zu Schweinen ist besonders gefährlich). Es besteht daher die Möglichkeit, dass aus einem Tierbecken ein neues Virus hervorgeht, für das der Mensch anfällig ist (wie es im letzten Jahrhundert beispielsweise mit dem spanischen Virus A-H1N1 von 1919 oder dem asiatischen Virus von 1919 geschehen ist) A-H2N2 von 1957).
Die eventuelle Übertragung zwischen Menschen würde eine weltweite Ausbreitung der Krankheit ermöglichen und somit eine Vogelgrippepandemie auslösen. Derzeit bleiben die Viren mit dem höchsten Pandemiepotential H5N1 und H7N9, da sie unter Hühnern weiter zirkulieren und beim Menschen schwere Krankheiten verursachen können. Andere Virussubtypen könnten eine Pandemie auslösen, das Risiko wird jedoch als geringer eingeschätzt.
